Bioinformatique

Intervenant : Philippe BARET 
       

Les développements récents des capacités de séquençage ont ouvert de nouvelles opportunités pour des études de génétique comparatives. L'objectif est de retracer l'évolution des gènes dans une perspective fonctionnelle.

Nous travaillons dans le cadre des consortiums Génolevures (www.genolevures.org) et Dikaryome au développement d'algorithmes d'identification des orthologues sur base du voisinage et de la similarité. Les principales applications concernent les transporteurs de sucres et la résistance aux drogues chez les levures.

Publications significatives

Cannon, R. D., E. Lamping, A. R. Holmes, K. Niimi, P. V. Baret, M. V. Keniya, et al., ‘Efflux-Mediated Antifungal Drug Resistance’, Clinical Microbiology Reviews, 22 (2009), 291-321 more

Palma, M., M. L. Seret, et P. V. Baret, ‘Combined Phylogenetic and Neighbourhood Analysis of the Hexose Transporters and Glucose Sensors in Yeasts’, FEMS Yeast Res, 9 (2009), 526-534. more

Seret, M. L., J. F. Diffels, A. Goffeau, et P. V. Baret, ‘Combined Phylogeny and Neighborhood Analysis of the Evolution of the ABC Transporters Conferring Multiple Drug Resistance in Hemiascomycete Yeasts’, Bmc Genomics, 10 (2009), 459 more

The Genolevures Consortium, J.-L. Souciet, B. Dujon, C. Gaillardin, M. Johnston, P. V. Baret, et al., ‘Comparative Genomics of Protoploid Saccharomycetaceae’, Genome Research, 19 (2009), 1696-1709 more