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Modélisation de systèmes biologiques [ LGBIO2060 ]


5.0 crédits ECTS  30.0 h + 30.0 h   1q 

Enseignant(s) Bastin Georges ; Lefèvre Philippe ;
Langue
d'enseignement:
Français
Lieu de l'activité Louvain-la-Neuve
Thèmes abordés Ce cours exposera tout d'abord la manière dont un modèle mathématique est construit dans le domaine biomédical, à partir des lois de base de la nature. Il décrira comment sa mise au point est toujours accompagnée d'une démarche expérimentale visant à obtenir des données qui sont à la base du développement du nouveau modèle. Le modèle mathématique sera présenté comme un outil qui permet d'expliquer les mécanismes de base du système et qui sert à prédire le comportement du système lorsqu'il est soumis à de nouveaux stimuli. Les différentes étapes de développement d'un nouveau modèle seront exposées : observation initiale, hypothèse, test du modèle et validation. Les différents types de modèles seront décrits et illustrés par des exemples : déterministes ou stochastiques ; statiques, dynamiques ou chaotiques ; paramétriques ou non paramétriques ; distribués ou non distribués. Ces notions seront illustrées par des exemples de modèles mathématiques dans le domaine biomédical : modèles en physiologie (ex : Hodgkin-Huxley), modèles à compartiments, modèles de populations.
Acquis
d'apprentissage
1. Objectifs (en termes de compétences) - comprendre les éléments de base de biologie nécessaires pour la conception de modèles mathématiques. - comprendre et être capable de modéliser différentes catégories de systèmes biologiques en employant les types de modèles appropriés. - faire un choix argumenté entre différentes types de modèles en fonction de l'application. - capacité à utiliser les outils informatiques nécessaires à l'implémentation des modèles développés et à leur simulation numérique.
Contenu - Introduction - Bien comprendre le système biologique pour bien le modéliser - Construction du modèle, test et validation - Différents types de modèles de systèmes biologiques Méthode pédagogique : cours magistraux et travaux pratiques.
Autres infos Néant
Cycle et année
d'étude
> Master [120] : ingénieur civil en informatique
> Master [120] : ingénieur civil en mathématiques appliquées
> Master [120] : ingénieur civil électricien
> Master [120] : ingénieur civil biomédical
> Master [120] : ingénieur civil électromécanicien
> Master [120] : ingénieur civil mécanicien
> Master [120] en statistiques, orientation biostatistique
Faculté ou entité
en charge
> GBIO


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