Diplômes

Compétences

• Mycologie
• Phytopathologie/épidémiologie
• Contrôle biologique des agents pathogènes fongiques
• Phylogénie et taxonomie des champignons 

Durant le projet de recherche Caractérisation et dynamique des fusarioses sur maïs en Région Wallonne (DGARNE D31-7055, 2005-2011), plus de 7200 souches fongiques ont été isolées et forment maintenant une des plus grandes collections européennes de souches fongiques provenant de plants de maïs. Ce projet a notamment mis en évidence une grande diversité de Fusarium pathogènes du maïs (24 espèces différentes répertoriées), dont beaucoup sont productrices de mycotoxines. F. avenaceum, F. culmorum et F. temperatum (une nouvelle espèce décrite dans ce projet) sont des agents de fonte de semis très actifs dans nos champs et, en fin de saison, F. graminearum et F. crookwellense sont presque toujours impliqués dans la fusariose. En culture de maïs, les moyens de lutte sont tous préventifs : le traitement de la semence (enrobage de fongicide, insecticide et répulsif), les bonnes pratiques culturales (rotation, date de semis et travail du sol) et la sélection variétale (hybride résistant).

Sur base de ces constatations, deux autres projets de recherche ont été initiés :

L'objectif principal du projet de recherche Criblage d'organismes fongiques naturellement présents dans la rhizosphère du maïs pour le développement de biofongicides et la détection de molécules actives associées (DGARNE D31-1287, 2011- en cours) est de sélectionner et caractériser des microorganismes « bénéfiques » présents dans la rhizosphère des plantules de maïs et capables de contrôler biologiquement des populations d'agents pathogènes présentes dans le sol. Un criblage in vitro de ces organismes est en cours afin de caractériser leur potentiel de contrôle biologique sur chacun les principaux agents de fonte de semis (Fusarium sp., Rhizoctonia sp., Pythium sp.). L'efficacité des candidats sélectionnés sera ensuite vérifiée par test in vivo en serres et en champs et enfin, l'interaction entre le pathogène et son BCA (Biological Control Agent) antagoniste sera étudiée (compétition, parasitisme, antibiose par production de métabolites secondaires ou phénomène de résistance induite). Ce projet permettra à terme d'optimiser la réalisation des premières étapes requises en recherche et développement devant mener à la mise sur le marché d'une part, de biofongicides prometteurs à faible toxicité et respectueux de l'environnement, et d'autre part, de nouvelles molécules d'intérêt en vue d'augmenter la diversité des produits phytosanitaires.

Le projet de recherche Evaluation du risque de contamination du maïs et de ses dérivés par Fusarium crookwellense et ses mycotoxines, une espèce émergente en Belgique (RF 11/6246 PATOCS, 2012- en cours) émane de résultats récents pouvant avoir de lourdes implications sur la chaine alimentaire du maïs. En effet, F. crookwellense a été isolé chaque année, contaminant jusqu'à 44% des plants, parfois comme seule espèce présente, et à des fréquences parfois supérieures à celles de F. graminearum. Une étude préliminaire a montré la production importante de nivalénol et de zéaralénone, deux mycotoxines préoccupantes, et des tests pathogènes ont montré que F. crookwellense est très agressif sur maïs. La possibilité d'avoir en Belgique des souches clonales (pas de reproduction sexuée connue à ce jour) très pathogènes et toutes productrices de toxines est donc potentiellement à très haut risque. L'objectif du projet sera donc d'évaluer l'existence d'un risque potentiel lié à la présence de F. crookwellense en Belgique, tant au niveau de sa contribution dans le développement de la fusariose que sur sa capacité mycotoxigénique. De plus, l'obtention de connaissances supplémentaires sur sa diversité génétique et sur les risques toxiques pour la chaine alimentaire contribuera à l'élaboration de mesures sanitaires adéquates.

Papers in international journals

Scauflaire J, Gourgue M, Foucart G, Renard F, Vandeputte F, Munaut F (2013). Fusarium miscanthi and other Fusarium species as causal agents of Miscanthus × giganteus rhizome rot. European Journal of Plant Pathology, doi: 10.1007/s10658-013-0220-9.

Pintos-Varela C, Aguín-Casal O, Chaves-Padín M, Ferreiroa-Martínez V, Sainz MJ, Scauflaire J, Munaut F, Bande M-J, Mansilla-Vázquez JP (2013). First Report of Fusarium temperatum Causing Seedling Blight and Stalk Rot on Maize in Spain. Plant Disease, doi : 10.1094/PDIS-02-13-0167-PDN.

Geiser DM, Aoki T, Bacon CW, Baker SE, Bhattacharyya MK, Brandt ME, Brown DW, Burgess LW, Chulze S, Coleman JJ, Correll JC, Covert SF, Crous PW, Cuomo CA, De Hoog GS, Di Pietro A, Elmer WH, Epstein L, Frandsen RJN, Freeman S, Gagkaeva T, Glenn AE, Gordon TR, Gregory NF, Hammond-Kosack KE, Hanson LE, Jímenez-Gasco M, Kang S, Kistler HC, Kuldau GA, Leslie JF, Logrieco A, Lu G, Lysøe E, Ma LJ, McCormick SP, Migheli Q, Moretti A, Munaut F, O'Donnell K, Pfenning L, Ploetz RC, Proctor RH, Rehner SA, Robert VARG, Rooney AP, bin Salleh B, Scandiani MM, Scauflaire J, Short DPG, Steenkamp E, Suga H, Summerell BA, Sutton DA, Thrane U, Trail F, Van Diepeningen A, VanEtten HD, Viljoen A, Waalwijk C, Ward TJ, Wingfield MJ, Xu JR, Yang XB, Yli-Mattila T, Zhang N (2013). One Fungus, One Name: Defining the Genus Fusarium in a Scientifically Robust Way That Preserves Longstanding Use. Phytopathology, 103, 400-408.

Rakotoniriana EF, Scauflaire J, Rabemanantsoa C, Urveg-Ratsimamanga S, Corbisier AM, Quetin-Leclercq J, Declerck S, Munaut F (2013). Colletotrichum gigasporum sp. nov., a new species of Colletotrichum producing long straight conidia. Mycological Progress, 12, 403-412.

Scauflaire J, Godet M, Gourgue M, Liénard C, Munaut F (2012). A multiplex real-time PCR method using hybridization probes for the detection and the quantification of Fusarium proliferatum, F. subglutinans, F. temperatum, and F. verticillioides. Fungal Biology, 116, 1073-1080.

Scauflaire J, Gourgue M, Callebaut A, Munaut F (2012). Fusarium temperatum, a mycotoxin-producing pathogen of maize. European Journal of Plant Pathology, 133, 911-922.

Scauflaire J, Mahieu O, Louvieaux J, Foucart G, Renard F, Munaut F (2011). Biodiversity of Fusarium species in ears and stalks of maize plants in Belgium. European Journal of Plant Pathology, 131, 59-66.

Scauflaire J, Gourgue M, Callebaut A, Pussemier L, Munaut F (2011). Pathogenicity and mycotoxin profile of Fusarium temperatum, an emergent pathogen of maize in Europe. Journal of Plant Pathology, 93, S1.19-S1.26.

Scauflaire J, Gourgue M, Munaut F (2011). Fusarium temperatum sp. nov. from maize, an emergent species closely related to Fusarium subglutinans. Mycologia, 103, 586-597.

Popularization papers

Scauflaire J, Munaut F (2009). Etat de la fusariose sur maïs en Wallonie. Les Nouvelles de l'Agriculture, Service Public de Wallonie, 3ème trimestre 2009, 34-35.

Munaut F, Van Hove F, Scauflaire J (2007). From plants to silage: the mycotoxin problematic. BCCM News, 20, 2-3.

Communications (Congres, symposium)

"Pathogenicity and mycotoxin profile of Fusarium temperatum, an emergent pathogen of maize in Belgium". Conference on Impact of plant pathogens on food quality of agricultural crops and wine (Patholux), 22 November 2010, Remich, Luxembourg.

"Biodiversity and distribution of Fusarium species on maize in Belgium". 11th European Fusarium Seminar, 20-23 September 2010, Radzikow, Poland.

"Fusarium temperatum, a new species from maize closely related to Fusarium subglutinans". 11th European Fusarium Seminar, 20-23 September 2010, Radzikow, Poland.

"Gibberella temperata (Fusarium temperatum) sp. nov. from maize in Belgium, an emergent species closely related to Fusarium subglutinans". Fusarium Satellite Meeting, 28-29 March 2010, Amsterdam, The Netherlands.

"Fusarium spp. on maize in the Region wallonne: biodiversity and mycotoxin production". 3rd symposium mycotoxins: threats and risk management, 28 April 2009, Gent, Belgium.

"Characterization and dynamics of fusariosis on maize in Belgium". 9th European Fusarium seminar, 19-22 September 2006, Wageningen, The Netherlands.

Biographie

Diplômes

Compétences

• Mycologie
• Phytopathologie/épidémiologie
• Contrôle biologique des agents pathogènes fongiques
• Phylogénie et taxonomie des champignons 

Recherche

Durant le projet de recherche Caractérisation et dynamique des fusarioses sur maïs en Région Wallonne (DGARNE D31-7055, 2005-2011), plus de 7200 souches fongiques ont été isolées et forment maintenant une des plus grandes collections européennes de souches fongiques provenant de plants de maïs. Ce projet a notamment mis en évidence une grande diversité de Fusarium pathogènes du maïs (24 espèces différentes répertoriées), dont beaucoup sont productrices de mycotoxines. F. avenaceum, F. culmorum et F. temperatum (une nouvelle espèce décrite dans ce projet) sont des agents de fonte de semis très actifs dans nos champs et, en fin de saison, F. graminearum et F. crookwellense sont presque toujours impliqués dans la fusariose. En culture de maïs, les moyens de lutte sont tous préventifs : le traitement de la semence (enrobage de fongicide, insecticide et répulsif), les bonnes pratiques culturales (rotation, date de semis et travail du sol) et la sélection variétale (hybride résistant).

Sur base de ces constatations, deux autres projets de recherche ont été initiés :

L'objectif principal du projet de recherche Criblage d'organismes fongiques naturellement présents dans la rhizosphère du maïs pour le développement de biofongicides et la détection de molécules actives associées (DGARNE D31-1287, 2011- en cours) est de sélectionner et caractériser des microorganismes « bénéfiques » présents dans la rhizosphère des plantules de maïs et capables de contrôler biologiquement des populations d'agents pathogènes présentes dans le sol. Un criblage in vitro de ces organismes est en cours afin de caractériser leur potentiel de contrôle biologique sur chacun les principaux agents de fonte de semis (Fusarium sp., Rhizoctonia sp., Pythium sp.). L'efficacité des candidats sélectionnés sera ensuite vérifiée par test in vivo en serres et en champs et enfin, l'interaction entre le pathogène et son BCA (Biological Control Agent) antagoniste sera étudiée (compétition, parasitisme, antibiose par production de métabolites secondaires ou phénomène de résistance induite). Ce projet permettra à terme d'optimiser la réalisation des premières étapes requises en recherche et développement devant mener à la mise sur le marché d'une part, de biofongicides prometteurs à faible toxicité et respectueux de l'environnement, et d'autre part, de nouvelles molécules d'intérêt en vue d'augmenter la diversité des produits phytosanitaires.

Le projet de recherche Evaluation du risque de contamination du maïs et de ses dérivés par Fusarium crookwellense et ses mycotoxines, une espèce émergente en Belgique (RF 11/6246 PATOCS, 2012- en cours) émane de résultats récents pouvant avoir de lourdes implications sur la chaine alimentaire du maïs. En effet, F. crookwellense a été isolé chaque année, contaminant jusqu'à 44% des plants, parfois comme seule espèce présente, et à des fréquences parfois supérieures à celles de F. graminearum. Une étude préliminaire a montré la production importante de nivalénol et de zéaralénone, deux mycotoxines préoccupantes, et des tests pathogènes ont montré que F. crookwellense est très agressif sur maïs. La possibilité d'avoir en Belgique des souches clonales (pas de reproduction sexuée connue à ce jour) très pathogènes et toutes productrices de toxines est donc potentiellement à très haut risque. L'objectif du projet sera donc d'évaluer l'existence d'un risque potentiel lié à la présence de F. crookwellense en Belgique, tant au niveau de sa contribution dans le développement de la fusariose que sur sa capacité mycotoxigénique. De plus, l'obtention de connaissances supplémentaires sur sa diversité génétique et sur les risques toxiques pour la chaine alimentaire contribuera à l'élaboration de mesures sanitaires adéquates.

liste de publications

Papers in international journals

Scauflaire J, Gourgue M, Foucart G, Renard F, Vandeputte F, Munaut F (2013). Fusarium miscanthi and other Fusarium species as causal agents of Miscanthus × giganteus rhizome rot. European Journal of Plant Pathology, doi: 10.1007/s10658-013-0220-9.

Pintos-Varela C, Aguín-Casal O, Chaves-Padín M, Ferreiroa-Martínez V, Sainz MJ, Scauflaire J, Munaut F, Bande M-J, Mansilla-Vázquez JP (2013). First Report of Fusarium temperatum Causing Seedling Blight and Stalk Rot on Maize in Spain. Plant Disease, doi : 10.1094/PDIS-02-13-0167-PDN.

Geiser DM, Aoki T, Bacon CW, Baker SE, Bhattacharyya MK, Brandt ME, Brown DW, Burgess LW, Chulze S, Coleman JJ, Correll JC, Covert SF, Crous PW, Cuomo CA, De Hoog GS, Di Pietro A, Elmer WH, Epstein L, Frandsen RJN, Freeman S, Gagkaeva T, Glenn AE, Gordon TR, Gregory NF, Hammond-Kosack KE, Hanson LE, Jímenez-Gasco M, Kang S, Kistler HC, Kuldau GA, Leslie JF, Logrieco A, Lu G, Lysøe E, Ma LJ, McCormick SP, Migheli Q, Moretti A, Munaut F, O'Donnell K, Pfenning L, Ploetz RC, Proctor RH, Rehner SA, Robert VARG, Rooney AP, bin Salleh B, Scandiani MM, Scauflaire J, Short DPG, Steenkamp E, Suga H, Summerell BA, Sutton DA, Thrane U, Trail F, Van Diepeningen A, VanEtten HD, Viljoen A, Waalwijk C, Ward TJ, Wingfield MJ, Xu JR, Yang XB, Yli-Mattila T, Zhang N (2013). One Fungus, One Name: Defining the Genus Fusarium in a Scientifically Robust Way That Preserves Longstanding Use. Phytopathology, 103, 400-408.

Rakotoniriana EF, Scauflaire J, Rabemanantsoa C, Urveg-Ratsimamanga S, Corbisier AM, Quetin-Leclercq J, Declerck S, Munaut F (2013). Colletotrichum gigasporum sp. nov., a new species of Colletotrichum producing long straight conidia. Mycological Progress, 12, 403-412.

Scauflaire J, Godet M, Gourgue M, Liénard C, Munaut F (2012). A multiplex real-time PCR method using hybridization probes for the detection and the quantification of Fusarium proliferatum, F. subglutinans, F. temperatum, and F. verticillioides. Fungal Biology, 116, 1073-1080.

Scauflaire J, Gourgue M, Callebaut A, Munaut F (2012). Fusarium temperatum, a mycotoxin-producing pathogen of maize. European Journal of Plant Pathology, 133, 911-922.

Scauflaire J, Mahieu O, Louvieaux J, Foucart G, Renard F, Munaut F (2011). Biodiversity of Fusarium species in ears and stalks of maize plants in Belgium. European Journal of Plant Pathology, 131, 59-66.

Scauflaire J, Gourgue M, Callebaut A, Pussemier L, Munaut F (2011). Pathogenicity and mycotoxin profile of Fusarium temperatum, an emergent pathogen of maize in Europe. Journal of Plant Pathology, 93, S1.19-S1.26.

Scauflaire J, Gourgue M, Munaut F (2011). Fusarium temperatum sp. nov. from maize, an emergent species closely related to Fusarium subglutinans. Mycologia, 103, 586-597.

Popularization papers

Scauflaire J, Munaut F (2009). Etat de la fusariose sur maïs en Wallonie. Les Nouvelles de l'Agriculture, Service Public de Wallonie, 3ème trimestre 2009, 34-35.

Munaut F, Van Hove F, Scauflaire J (2007). From plants to silage: the mycotoxin problematic. BCCM News, 20, 2-3.

Communications (Congres, symposium)

"Pathogenicity and mycotoxin profile of Fusarium temperatum, an emergent pathogen of maize in Belgium". Conference on Impact of plant pathogens on food quality of agricultural crops and wine (Patholux), 22 November 2010, Remich, Luxembourg.

"Biodiversity and distribution of Fusarium species on maize in Belgium". 11th European Fusarium Seminar, 20-23 September 2010, Radzikow, Poland.

"Fusarium temperatum, a new species from maize closely related to Fusarium subglutinans". 11th European Fusarium Seminar, 20-23 September 2010, Radzikow, Poland.

"Gibberella temperata (Fusarium temperatum) sp. nov. from maize in Belgium, an emergent species closely related to Fusarium subglutinans". Fusarium Satellite Meeting, 28-29 March 2010, Amsterdam, The Netherlands.

"Fusarium spp. on maize in the Region wallonne: biodiversity and mycotoxin production". 3rd symposium mycotoxins: threats and risk management, 28 April 2009, Gent, Belgium.

"Characterization and dynamics of fusariosis on maize in Belgium". 9th European Fusarium seminar, 19-22 September 2006, Wageningen, The Netherlands.